단백질-RNA 복합체의 검색과 시각화를 위한 웹 응용 프로그램

초록

단백질 서열에서 RNA와 결합하는 아미노산을 예측하는 기법이 최근에 연구되기 시작하였고, RNA 서열에서 단백질과 결합하는 염기를 예측하는 연구도 시도되고 있다. 만약 입력된 서열이 이미 알려진 단백질-RNA 복합체에 포함된 서열과 매우 비슷한 경우, 이 단백질-RNA 복합체에서 실제의 단백질-RNA의 결합 부위를 알려주는 것이 예측된 결합 부위를 알려주는 것보다 더욱 유용할 수 있다. 실제 결합 부위에 대한 정보는 예측 기법의 개발과 평가에서도 매우 유용하게 활용된다. 또한, 단백질-RNA 결합 부위를 예측하는 연구에서 필수적인 것 중의 하나가, 단백질-RNA 복합체의 구조가 알려진 경우 전체 복합체의 구조와 결합 부위를 시각적으로 보임으로써 결합 유형을 보다 직관적으로 파악할 수 있게 하는 것이다. 본 연구는 단백질-RNA 복합체의 서열을 효율적으로 검색하고, 검색된 단백질-RNA 복합체의 구조와 결합 부위를 시각화하는 웹 기반 응용 프로그램의 개발을 소개한다.